Trước khi tin học hóa, các hệ thống lưu trữ thủ công đã được sử dụng trong các kho lưu trữ dấu vân tay lớn. Các hệ thống phân loại thủ công được dựa trên các mẫu vân chung của một số hoặc tất cả các ngón tay (chẳng hạn như sự hiện diện hoặc vắng mặt của các mẫu vân hình tròn). Điều này cho phép nộp và lấy các bản ghi giấy trong các bộ sưu tập lớn chỉ dựa trên các mẫu sườn vân. Các hệ thống phổ biến nhất đã sử dụng lớp mẫu của mỗi ngón tay để tạo thành một khóa (một số) để hỗ trợ tra cứu trong hệ thống lưu trữ. Các hệ thống phân loại bao gồm hệ thống Roscher, hệ thống Juan Vucetich và Hệ thống phân loại Henry. Hệ thống Roscher được phát triển ở Đức và được triển khai ở cả Đức và Nhật Bản, hệ thống Vucetich (được phát triển bởi một sĩ quan cảnh sát người Croatia gốc Croatia) được phát triển ở Argentina và được triển khai trên khắp Nam Mỹ, và hệ thống Henry được phát triển ở Ấn Độ ở hầu hết các nước nói tiếng Anh.[10]

Trong hệ thống phân loại của Henry, có ba mẫu vân tay cơ bản: vòng lặp, vòng tròn (whorls) và hình vòm,[11] mà chứa 60-65%, 30-35% và 5% của tất cả các dấu vân tay tương ứng. Ngoài ra còn có các hệ thống phân loại phức tạp hơn, chia chi tiết các mẫu hơn nữa, thành các vòm đơn giản hoặc vòm nghiêng,[10] và thành các vòng có thể là hướng tâm hoặc vòng ulnar, tùy thuộc vào phía bên tay mà đuôi vân chỉ vào. Các vòng llnar bắt đầu ở phía bên ngón tay út, bên gần với ulna, xương cánh tay dưới. Các vòng xuyên tâm bắt đầu ở phía ngón tay cái của ngón tay, phía gần với xương quay. Whorls cũng có thể có các phân loại nhóm phụ bao gồm whorls đơn giản, whorls tình cờ, whorls vòng lặp đôi, mắt con công, composite và whorls vòng trung tâm.[10]

Các mẫu vân tay phổ biến khác bao gồm vòm nghiêng, vòm trơn và vòng bỏ túi trung tâm.

Hệ thống được sử dụng bởi hầu hết các chuyên gia, mặc dù phức tạp, tương tự như Hệ thống phân loại Henry. Nó bao gồm năm phân số, trong đó R là bên phải, L cho bên trái, i cho ngón trỏ, m cho ngón giữa, t cho ngón tay cái, r cho ngón đeo nhẫn và p (hồng hào) cho ngón út. Các phân số như sau: Ri / Rt + Rr / Rm + Lt / Rp + Lm / Li + Lp / Lr. Các số được gán cho mỗi bản in được dựa trên việc chúng có hay không. Một sự thay đổi trong phân số đầu tiên được cho là 16, thứ hai là 8, thứ ba là 4, thứ tư là 2 và 0 cho phân số cuối cùng. Vòng cung và vòng lặp được gán giá trị 0. Cuối cùng, các số trong tử số và mẫu số được thêm vào, sử dụng lược đồ:

và 1 được thêm vào cả trên và dưới, để loại trừ mọi khả năng chia cho 0. Ví dụ: nếu ngón đeo nhẫn bên phải và ngón trỏ bên trái có các vòng tròn, các phân số sẽ trông như thế này:

Sử dụng hệ thống này giúp giảm số lượng bản in mà bản in đang đề cập cần được so sánh với. Ví dụ: bộ bản in ở trên chỉ cần so sánh với bộ dấu vân tay khác có giá trị là 3.[12]